租车协议涉及的税种主要包括以下几种：
租车企业需要按照当地税收政策支付增值税，员工在租车合同中也需要报出增值税及相关税款。
如果企业提供的是代开发票的服务，且单次交易金额超过500元，税务机关将按照3%的征收率征收增值税。
租车企业根据营业收入情况，交纳所得税，分配比例一般是20%。
租赁收入作为企业的营业收入，需要按照规定的税率缴纳企业所得税。
如果员工承担的租车交易较多，他们需要根据当地的税收法律交纳个人所得税。
出租方（无论是企业还是个人）从租赁收入中获得的利润需要按照国家规定的比例缴纳个人所得税。
根据《印花税暂行条例》，签订汽车租赁协议要交0.1%的印花税，合同双方都需要缴纳印花税。
租赁机动车的企业或个人在购买车辆后，应当按照规定缴纳购置税。
租赁方在缴纳增值税的同时，还必须缴纳城市维护建设税和教育费附加。
根据地方政府的规定，可能还需要缴纳车船使用税、房产税等地方税种。
在特定时期内，个人车辆在从事租赁业务时可以享受增值税免税政策，同时无需为其他相关税费进行汇算清缴。
建议在签订租车协议前，详细咨询当地的税务机构或专业税务顾问，以确保合法合规并最大限度地减少税务负担。