违章施工通常由住房和城乡建设部门（住建局）负责管理和查处。具体来说：
1. 住房和城乡建设部门负责实施城市规划方面的监察，依据《中华人民共和国城乡规划法》及相关法规和规章，对城市规划区内的建设用地和建设行为进行监察。
2. 对于未取得建设工程规划许可证或者违反建设工程规划许可证的规定进行建设的行为，县级以上人民政府城市规划行政主管部门有权责令停止建设，限期拆除或者没收违法建筑物、构筑物或其他设施。
3. 乡镇人民政府和管委会也是控制和查处违法建设工作的责任主体，负责明确相关部门的责任，督促巡查控管工作，并采取查封、拆除等相应措施。
4. 公安部门负责维护拆除违法建设现场秩序，及时制止和查处阻碍国家机关工作人员依法执行职务等违法犯罪的行为。
5. 其他相关部门如水务、交通运输、园林、住房保障房管等部门也根据各自职责参与违法建设的查处工作。